Claire Redfieldová je spolu s Moirou - dcerou Barryho Burtona z prvního dílu - a dalšími členy organizace Terra Save (Záchrana Země)
unesena ozbrojenou jednotkou přímo z firemního večírku. Probouzejí se na děsivém
opuštěném ostrově neznámo kde. Zjišťují však, že jejich životy zde ovládá jediná osoba - záhadný "Overseer" (dozorce).
Několik měsíců poté začíná druhá část hry, v níž se další hlavní hrdina, samotný Barry, vydává na ostrov pátrat po své dceři.
Hned zkraje na ostrově objeví záhadnou malou dívku jménem Natalia, jež má nadlidské schopnosti.
Základem příběhu je strach, napětí a spiknutí, čemuž budeme čelit od začátku až do úplného konce...